2011年,学校搬至凤凰山麓的新址,即原莆田三中的所在地,紧邻城厢区政府,便利了学校的运营和发展。这一搬迁使得学校与万达广场、南湖公园、荔城大道及千年古刹广化寺等形成了良好的周边环境,为学生提供了优越的地理和人文条件。
1999年秋季高、初中分离分设,高中部乔迁新址,校名沿用莆田第五中学。2005年3月学校被确认为福建省普通中学一级达标学校。建校八十一年来,学校的教育教学成绩显著,英才辈出,在社会上赢得了高度赞誉。
1999年秋季高、初中分离,高中部迁往新址:高中部乔迁 位于梅山路的 前福建高级妇幼卫生学校 的地方(福建高级妇幼卫生学校 改制为福建医科大学莆田分校、福建莆田学院医学部)新址 , 校名沿用莆田第五中学,初中部 改为私立中山中学 ,高中部成为独立高中 ,校名沿用莆田第五中学。
现在莆田学院附属医院旧院区隔壁)等,1935年撤销,1942年才复校,40年代末期迁含携往驿前(现中山中学一带),50年代中山中学改名莆田五中,1995年因为高中不能举办初中,初中部和高中部分立,高中部搬迁到 安福村原福建妇幼卫生学校校区,2013年搬迁到罗汉峰中部现址。
莆田的五中就一个。在哲理中学(莆田旧二中)旁边,中山中学是初中的。曾经是五中的初中部。现在早就不是了。